Sinopsis: La cuatro tortugas, expertas en artes marciales nuevamente hacen historia, esta vez deben escapar del plan siniestro del malvado Shredder, quien secuestra al profesor Jordan Perry, creador del ”Moco Verde” que hace posible la mutación de las Tortugas. Poco después, Shredder aplica la preciada sustancia a dos criaturas que acaba de reclutar, convirtiéndolos en terribles e imponentes guerreros ninja que se lucharán en un duelo a muerte con los héroes de color verde.